菌界(Fungi)

ホロマイコータ(Holomycota)
= 菌界(Kingdom Fungi)

Nucletmyceaとも。カビやキノコの仲間です。菌糸や子実体を形成するものが多いです。

真菌類(Eumycota)(当サイト分類表の青色)が最も狭義の菌界です。もう少し意味を広げてロゼラ亜界(Rozellomyceta)、アフェリディウム門(Aphelida)(当サイト分類表の青緑色)も菌界に含む場合もあります(Zoosporia)。

当サイトでは、さらに範囲を広げ、Zoosporia(狭義の菌界)に近縁なクリスティディスコイディア亜門(Cristidiscoidia)(当サイト分類表の黄色)も菌界としています(ホロマイコータ(Holomycota))。姉妹群は動物界(Animalia)です。

伝統的には変形菌門(Phylum Myxomycota)、鞭毛菌門(Phylum Mastigomycota)、接合菌門(Phylum Zygomycota)、子嚢菌門(Phylum Ascomycota)、担子菌門(Phylum Basidiomycota)、不完全菌門(Phylum Deuteromycota)の6門(または2門と5亜門)に分ける分類が行われてきました。

• 変形菌門(Phylum Myxomycota)[多系統群(polyphyletic)] - 後に菌界から外される
  (アメーバ動物門の変形菌綱(または動菌下門)、ストラメノパイル上門のラビリンチュラ菌門、リザリア下界のフィトミクサ綱(ネコブカビ)、エクスカバータ界のヘテロロボセア綱アクラシス目など)
• 真菌類(Eumycota) - このクレードを門階級とし、配下の5門を亜門階級とする場合あり
  • 鞭毛菌門(Phylum Mastigomycota)[多系統群(polyphyletic)] - 後に菌界に所属する3門、菌界から外された2綱などに分けられる
    (菌界に所属するツボカビ門、ネオカリマスティクス菌門、コウマクノウキン門、菌界から外されたストラメノパイル上門の卵菌綱、サカゲツボカビ綱(または偽菌門)など)
  • 接合菌門(Phylum Zygomycota)[多系統群(polyphyletic)] - 後に1門4亜門に分けられる(一部は菌界から外される)
    (グロムス菌門、ケカビ亜門、ハエカビ亜門、トリモチカビ亜門、キックセラ亜門、菌界から外された動物界のアメービディウム門)
  • 子嚢菌門(Phylum Ascomycota)
  • 担子菌門(Phylum Basidiomycota)
  • 不完全菌門(Phylum Deuteromycota) - 現在では分類群としては認められていない(子嚢菌門、担子菌門などに統合)

しかし近年の分子系統解析に伴い、変形菌門はそもそも菌界ではなく、鞭毛菌門と接合菌門は多系統群であることが分かってきたため、現在では分類の大幅な見直しが行われています。[Hibbett et al. (2007)]など

当サイトでは、15門(ディカリア(二核菌)亜界に所属する2門、ディカリア亜界以外の真菌類に所属する10門(または7門4亜門)、真菌類に所属しない3門)と所属門不明の1亜門を認めます。

真菌類に所属しない3門間、および真菌類に所属する10門(または7門4亜門)1亜界間の関係ははっきりしていません。

菌界の分類は現在も活発に議論されており、未だ定まらない部分が多く、下記の分類も暫定的です。

(なお、当サイトでは英語版Wikipedia及びWikispecies情報を参考に8つの亜界階級を記載していますが、ディカリア(二核菌)亜界以外の亜界は暫定的です。[Tedersoo et al. (2018)])

ヌクレアリア亜界(Subkingdom Nucleariae)
= クリスティディスコイディア亜門(Subphylum Cristidiscoidia)

ヌクレアリアの仲間です。糸状仮足を持つアメーバ様生物で、土壌や淡水から見つかります。外見は太陽虫に似ていて、自由生活型のものと寄生性のものの両方が存在します。

Zoosporia(狭義の菌界)には含めませんが、ホロマイコータ(Holomycota) = 広義の菌界には含めます。Zoosporiaの姉妹群と推定されます。

(なお、[Tedersoo et al. (2018)]ではヌクレアリア界(Kingdom Nucleariae)としています。(当サイトでは菌界 = ホロマイコータと定義しているため、一段下げて亜界階級として記載しています。))

• クリスティディスコイデア綱(Class Cristidiscoidea)(ディスキクリストイデア綱(Class Discicristoidea))

ロゼラ亜界(Subkingdom Rozellomyceta)

微胞子虫門とクリプト菌門が近縁である学説に基づいて設けられることがある分類群です。2門から成ります。

微胞子虫門(Phylum Microsporidia)

微胞子虫の仲間です。かつては原生生物の一種だと思われていましたが、現在は菌界の一種だと考えられています。真菌類(最も狭義の菌界)には含めませんが、Zoosporia(狭義の菌界)には含めます。

ミトコンドリアがなく、代わりにマイトソームと呼ばれる器官があります。ヒトを含む動物に日和見感染(免疫力が低下した時に感染)する病原体が知られています。

• 微胞子虫綱(Class Microsporea)

クリプト菌門(Phylum Cryptomycota)

ロゼラ門(Phylum Rozellomycota)とも。鞭毛菌類(ツボカビ亜界、コウマクノウキン門、偽菌門)に寄生する鞭毛菌の仲間です。

他の鞭毛菌類と単系統を成さず、むしろ姉妹群は微胞子虫門とも言われています。

• ロゼラ綱(Class Rozellidea)

アフェリディウム亜界(Subkingdom Aphelidiomyceta)
= アフェリディウム門(Phylum Aphelida)

アフェリディウムの仲間です。藻類に寄生する生物で、過去にはホロゾア(広義の動物界)に分類されていたこともありますが、最近では菌界の方に分類されることが多いです。

他の菌界生物と単系統を成さないようで、独立した門が与えられています。

• アフェリディウム綱(Class Aphelidea)

ツボカビ亜界(Subkingdom Chytridiomyceta)

ツボカビ門とネオカリマスティクス菌門が近縁である学説に基づいて設けられることがある分類群です。2門から成ります。

ツボカビ門(Phylum Chytridiomycota)

ツボカビの仲間です。鞭毛を形成するのが特徴で、遊走細胞を放出する際の姿が壺を思わせるものがあることからこの名があります。かつて鞭毛菌門に所属していました。

両生類に病気を引き起こすカエルツボカビ(Batrachochytrium dendrobatidis)が特に有名です。

• ツボカビ綱(Class Chytridiomycetes)
  • ツボカビ目(Order Chytridiales) - カエルツボカビ
  • (...etc)
• サヤミドロモドキ菌綱(Class Monoblepharidomycetes)

ネオカリマスティクス菌門(Phylum Neocallimastigomycota)

ネオカリマスティクス門とも。絶対嫌気性(酸素を嫌う、大量の酸素があると死滅する)の菌界の仲間です。反芻動物など草食動物の消化器に存在し、消化を助けていると考えられています。かつて鞭毛菌門に所属していました。

ミトコンドリアがなく、代わりにハイドロジェノソームと呼ばれる器官があります。最近の研究によりますと、恐らくツボカビ門に近縁(姉妹群の可能性もあり)です。

• ネオカリマスティクス菌綱(Class Neocallimastigomycetes)

コウマクノウキン亜界(Subkingdom Blastocladiomyceta)
= コウマクノウキン門(Phylum Blastocladiomycota)

漢字で書くと厚膜嚢菌(こうまくのうきん)。その名の通り厚い細胞壁に覆われた休眠胞子嚢を持つ種が多いです。かつて鞭毛菌門に所属していました。

ツボカビ門同様、鞭毛を持つ遊走子を放ちますが、ツボカビ門と単系統を成さない可能性が高く、独立門に格上げされています。

• コウマクノウキン綱(Class Blastocladiomycetes)

トリモチカビ亜界(Subkingdom Zoopagomyceta)

ハエカビ亜門、トリモチカビ亜門、キックセラ亜門、バシディオボルス門、フクロカビ門が近縁である学説に基づいて設けられることがある分類群です。4門(または2門3亜門)から成ります。

ハエカビ門(Phylum Entomophthoromycota)
= ハエカビ亜門(Subphylum Entomophthoromycotina)

ハエなどの昆虫に寄生する寄生菌を多く含む菌界の仲間です。所属門がはっきりしない亜門で、2綱2目から成ります。かつて接合菌門に所属していました。

英語版Wikipedia情報から当サイトの分類表では暫定的にハエカビ門(Phylum Entomophthoromycota)に所属させています。

ハエカビのような典型的な昆虫寄生菌からバシディオボルスの仲間のような自由生活型の菌が存在します。

なおバシディオボルス綱は他のハエカビ亜門と単系統を成さないとして、独立したバシディオボルス門(Phylum Basidiobolomycota)とする学説もあります。(2020年04月追記：採用しました。バシディオボルス門の項目も参照。)

• ハエカビ綱(Class Entomophthoromycetes)
• バシディオボルス綱(Class Basidiobolomycetes)
• ネオジギテス綱(Class Neozygitomycetes)

キックセラ門(Phylum Kickxellomycota)

トリモチカビ亜門とキックセラ亜門が近縁である学説に基づいて設けられることがある分類群です。2亜門から成ります。

(トリモチカビ亜門を独立したトリモチカビ門とする場合はキックセラ亜門のみから成ります。)

トリモチカビ亜門(Subphylum Zoopagomycotina)

トリモチカビ、ゼンマイカビ、エダカビなどの仲間です。所属門がはっきりしない亜門で、1綱1目のみから成ります。かつて接合菌門に所属していました。

キックセラ亜門に近縁で、英語版Wikipedia情報から当サイトの分類表では暫定的にキックセラ門(Phylum Kickxellomycota)に所属させています。

(独立したトリモチカビ門(Phylum Zoopagomycota)とする学説もあります。)

他の生物(小動物、あるいは菌類)に寄生したり、捕らえて吸収するものが知られています。

• トリモチカビ綱(Class Zoopagomycetes)

キックセラ亜門(Subphylum Kickxellomycotina)

キックセラ、ブラシカビ、ディマルガリス、ハルペラ、アセラリアなどの仲間です。所属門がはっきりしない亜門で、2綱4目から成ります。かつて接合菌門に所属していました。

英語版Wikipedia情報から当サイトの分類表では暫定的にキックセラ門(Phylum Kickxellomycota)に所属させています。

キックセラ目、ディマルガリス目は主に土壌や動物の糞に見られ、ハルペラ目、アセラリア目は主に昆虫などの腸内に寄生します。

• キックセラ綱(Class Kickxellomycetes)
  • キックセラ目(Order Kickxellales) - キックセラ、ブラシカビ
  • ハルペラ目(Order Harpellales)
  • アセラリア目(Order Asellariales)
• ディマルガリス綱(Class Dimargaritomycetes)
  • ディマルガリス目(Order Dimargaritales)

バシディオボルス門(Phylum Basidiobolomycota)

バシディオボルスの仲間です。動物の糞の上などで自由生活します。1綱1目のみから成ります。かつて接合菌門に所属していました。

ハエカビ亜門に分類する場合もあります(ハエカビ亜門の項目も参照)。最近の系統解析では姉妹群がフクロカビ門との結果も出ています。

• バシディオボルス綱(Class Basidiobolomycetes)

フクロカビ門(Phylum Olpidiomycota)

フクロカビの仲間です。植物や動物などに寄生する鞭毛菌の仲間で、かつては鞭毛菌門やツボカビ門に所属していました。

他の鞭毛菌類と単系統を成さず、最近の解析結果では姉妹群がバシディオボルス綱とも言われています。

• フクロカビ綱(Class Olpidiomycetes)

ケカビ亜界(Subkingdom Mucoromyceta)

ケカビ亜門、カルカリスポリエラ門、グロムス菌門が近縁である学説に基づいて設けられることがある分類群です。3門から成ります。

ケカビ門(Phylum Mucoromycota)
= ケカビ亜門(Subphylum Mucoromycotina)

ケカビ、クモノスカビ、アツギケカビ、クサレケカビなどの仲間です。所属門がはっきりしない亜門で、2綱3目から成ります。かつて接合菌門に所属していました。

英語版Wikipedia情報から当サイトの分類表では暫定的にケカビ門(Phylum Mucoromycota)に所属させています。

ケカビやクモノスカビなどごく一般的に見られるカビを含みます。一部の種は弱い病原体として動物や植物に感染することもあります。また一部の種は日本以外のアジアなどで発酵食品や酒の製造に使われています。

なおクサレケカビ綱は他のケカビ亜門と単系統を成さないとして、独立したクサレケカビ門(Phylum Mortierellomycota)とする学説もあります。

• ケカビ綱(Class Mucoromycetes)
  • ケカビ目(Order Mucorales) - ケカビ、クモノスカビ
  • アツギケカビ目(Order Endogonales)
• クサレケカビ綱(Class Mortierellomycetes)

カルカリスポリエラ門(Phylum Calcarisporiellomycota)

カルカリスポリエラの仲間です。1綱1目のみから成ります。かつて接合菌門や不完全菌門に所属していました。

ケカビ亜門に含める場合もありますが、最近は独立門とする傾向が強いようです。

• カルカリスポリエラ綱(Class Calcarisporiellomycetes)

グロムス菌門(Phylum Glomeromycota)

グロムス門とも。陸上植物(有胚植物上門)と共生する菌界の仲間です。アーバスキュラー菌根と呼ばれる菌根を形成し、リン酸や水分の吸収を助けていると推測されます(その代り栄養分を分けてもらいます)。かつて接合菌門に所属していました。

例外的にゲオシフォン(Geosiphon pyriformis または Geosiphon pyriforme)は陸上植物ではなくシアノバクテリア(ネンジュモの仲間)と細胞内共生していることが知られています。

最近の研究によりますと、ディカリア(二核菌)亜界と近縁ですが、ケカビ亜門の方により近縁である可能性が高いです。

• グロムス菌綱(Class Glomeromycetes)
  • アーケオスポラ目(Order Archaeosporales) - ゲオシフォン
  • ディバーシスポラ目(Order Diversisporales)
  • グロムス目(Order Glomerales)
  • パラグロムス目(Order Paraglomerales)

ディカリア(二核菌)亜界(Subkingdom Dikarya)

一般的な意味での菌類の大半がここに所属します。生活環の少なくとも一部において1つの細胞の中に2つの核が共存する重相の世代を持ちます。

菌界の9割以上を占める大きなグループです。子嚢菌門と担子菌門の2門から成ります(エントリザ門を加えて3門とする学説もあります)。

子嚢菌門(Phylum Ascomycota)

大半のカビや酵母、一部のキノコ(トリュフなど)などの仲間です。減数分裂で生成した胞子を子嚢という名の袋の中に作るのが特徴です。

• タフリナ菌亜門(Subphylum Taphrinomycotina)
• Saccharomyceta
  • サッカロミセス亜門(Subphylum Saccharomycotina)
  • チャワンタケ亜門(Subphylum Pezizomycotina)

担子菌門(Phylum Basidiomycota)

大半のキノコ、サビキンやクロボキンなどの植物寄生菌などの仲間です。担子器という名の細胞の外に胞子が形成されるのが特徴です。

• エントリザ菌綱(Class Entorrhizomycetes)
• 狭義の担子菌門(Phylum Basidiomycota sensu stricto)
  • プクシニア菌(サビキン)亜門(Subphylum Pucciniomycotina)
  • Orthomycotina
    • クロボキン亜門(Subphylum Ustilaginomycotina)
    • ハラタケ(菌蕈)亜門(Subphylum Agaricomycotina)