ポジバクテリア亜界(Posibacteria)

ポジバクテリア亜界(Subkingdom Posibacteria)

グラム陽性菌を中心とするグループです。外膜を持たず、厚いペプチドグリカン層に特徴づけられます(例外有り)。

最近の系統解析によると、単系統群である可能性が高いです。但し含まれる門は分類体系により異なる場合があります。

姉妹群ははっきりしていません(一説によればシアノバクテリア・メライナバクテリア群以外のネジバクテリア亜界とも)。

フィルミクテス門や放線菌門が有名です。当サイトでは暫定的に5門を認めます。

5つの門の間の関係ははっきりしていません(フィルミクテス門とテネリクテス門は特に近縁なようです)。

フィルミクテス門(Phylum Firmicutes)

グラム陽性細菌門とも。放線菌門と並ぶ典型的なグラム陽性細菌で、暫定的に5綱9目を含みます。

フィルミクテス(Firmicutes)とはラテン語で強固な皮膚という意味で、グラム陽性菌の厚いペプチドグリカン層に由来しています。

乳酸菌や枯草菌(納豆菌など)、炭疽菌、ブドウ球菌、ボツリヌス菌など有名な細菌を多く含みます。

• バチルス綱(Class Bacilli)
  • バチルス目(Order Bacillales) - 枯草菌(納豆菌など)、炭疽菌、セレウス菌、ブドウ球菌(黄色ブドウ球菌など)
  • ラクトバチルス目(Order Lactobacillales) - 乳酸菌の大半、レンサ球菌(ミュータンス菌、肺炎球菌など)
• クロストリディウム綱(Class Clostridia)
  • クロストリディウム目(Order Clostridiales) - ウェルシュ菌、破傷風菌、ボツリヌス菌、ヘリオバクテリア
  • ハロアナエロビウム目(Order Halanaerobiales)
  • テルモアナエロバクター目(Order Thermoanaerobacterales)
  • ナトロアナエロビウス目(Order Natranaerobiales)
• エリシペロスリックス綱(Class Erysipelotrichia)
  • エリシペロスリックス目(Order Erysipelotrichales)
• テルモリトバクター綱(Class Thermolithobacteria)
  • テルモリトバクター目(Order Thermolithobacterales)
• ネガティヴィクテス綱(Class Negativicutes)
  • セレノモナス目(Order Selenomonadales)

テネリクテス門(Phylum Tenericutes)

細胞壁を欠いた細菌のグループで、モリクテス綱(Mollicutes)1綱のみを含みます。暫定的に5目を含みます。

テネリクテス(Tenericutes)やモリクテス(Mollicutes)はいずれもラテン語で柔らかい皮膚という意味で、細胞壁(ペプチドグリカン層)を欠き細胞膜が露出した柔らかい細胞に由来しています。

細胞壁を欠くためグラム陰性ですが、外膜を持たずフィルミクテス門に近縁であるためポジバクテリア亜界に含めています(フィルミクテス門モリクテス綱とする分類もあります)。

細胞サイズが小さく、他の真核生物細胞に寄生することに特化している種が多いです(自由生活型の種もいます)。マイコプラズマやファイトプラズマが有名です。

• モリクテス綱(Class Mollicutes)
  • マイコプラズマ目(Order Mycoplasmatales)
  • エントモプラズマ目(Order Entomoplasmatales)
  • アコレプラズマ目(Order Acholeplasmatales) - ファイトプラズマ
  • アナエロプラズマ目(Order Anaeroplasmatales)
  • ハロプラズマ目(Order Haloplasmatales)

放線菌門(Phylum Actinobacteria)

フィルミクテス門と並ぶ典型的なグラム陽性細菌で、暫定的に6綱29目を含む大きめのグループです。フィルミクテス門と比較するとDNAのGC含量が高い特徴があります。

菌糸を放射状に伸ばすものが多いためこの名があります。「Actino～」とはギリシャ語で放射(ακτίς)という意味です。

ビフィズス菌、結核菌、らい菌、ジフテリア菌、アクネ菌、ストレプトマイシン生産菌などが有名です。

• 放線菌綱(Class Actinobacteria)
  • アクチノミセス目(Order Actinomycetales)
  • ビフィドバクテリウム目(Order Bifidobacteriales) - ビフィズス菌
  • コリネバクテリウム目(Order Corynebacteriales) - 結核菌、らい菌、ジフテリア菌
  • プロピオニバクテリウム目(Order Propionibacteriales) - アクネ菌
  • ストレプトミセス目(Order Streptomycetales) - ストレプトマイシン生産菌
  • (...etc)
• アシドミクロビウム綱(Class Acidimicrobiia)
  • アシドミクロビウム目(Order Acidimicrobiales)
• コリオバクター綱(Class Coriobacteriia)
  • コリオバクター目(Order Coriobacteriales)
  • Eggerthellales目(Order Eggerthellales)
• ニトリリルプトル綱(Class Nitriliruptoria)
  • ニトリリルプトル目(Order Nitriliruptorales)
  • ユーゼバイア目(Order Euzebyales)
  • (...etc)
• ルブロバクター綱(Class Rubrobacteria)
  • ルブロバクター目(Order Rubrobacterales)
• テルモレオフィルム綱(Class Thermoleophilia)
  • テルモレオフィルム目(Order Thermoleophilales)
  • ソリルブロバクター目(Order Solirubrobacterales)
  • ガイエラ目(Order Gaiellales)

クロロフレクスス門(Phylum Chloroflexi)

酸素非発生型の光合成を行う緑色非硫黄細菌(緑色滑走細菌)を始めとするグループで、暫定的に8綱11目を含みます。

グラム陰性菌が多いですが、グラム陽性菌も約1/3あり、外膜を持たずペプチドグリカン層も変わった組成になっています。

最近の系統解析ではグラム陽性菌に近縁とする説が出ており、当サイトではポジバクテリア亜界に含めています。

• クロロフレクスス綱(Class Chloroflexia)
  • クロロフレクスス目(Order Chloroflexales) - 緑色非硫黄細菌(緑色滑走細菌)
  • ヘルペトシフォン目(Order Herpetosiphonales)
• アナエロリネア綱(Class Anaerolineae)
  • アナエロリネア目(Order Anaerolineales)
• カルディリネア綱(Class Caldilineae)
  • カルディリネア目(Order Caldilineales)
• テルモミクロビウム綱(Class Thermomicrobia)
  • テルモミクロビウム目(Order Thermomicrobiales)
  • スファエロバクター目(Order Sphaerobacterales)
• クテドノバクター綱(Class Ktedonobacteria)
  • クテドノバクター目(Order Ktedonobacterales)
  • テルモゲマティスポラ目(Order Thermogemmatisporales)
• デハロコッコイデス綱(Class Dehalococcoidia)
  • デハロコッコイデス目(Order Dehalococcoidales)
• アルデンティカテナ綱(Class Ardenticatenia)
  • アルデンティカテナ目(Order Ardenticatenales)
• テルモフレクスス綱(Class Thermoflexia)
  • テルモフレクスス目(Order Thermoflexales)

アルマティモナス門(Phylum Armatimonadetes)

アルマティモナスの仲間で、暫定的に3綱3目を含みます。最近(2011年)提唱された新しい門です。

グラム陰性菌ですが、系統解析ではグラム陽性菌に近縁とする結果もあり[A new view of the tree of life - Nature Microbiology]、暫定的にポジバクテリア亜界に含めています(将来的には変更の可能性もあります)。

• アルマティモナス綱(Class Armatimonadia)
  • アルマティモナス目(Order Armatimonadales)
• クトノモナス綱(Class Chthonomonadetes)
  • クトノモナス目(Order Chthonomonadales)
• フィンブリイモナス綱(Class Fimbriimonadia)
  • フィンブリイモナス目(Order Fimbriimonadales)